Détails de la réservation
- Le : 9 May 2017
- De : 8 h 00
- à : 20 h 00
- Salle : Salle de Formation
Détails de l'évènement
Python pour la biologie
OBJECTIFS
- Etre capable de maintenir et développer de façon collaborative une application d'analyse de données biologiques en Python
- Savoir écrire des scripts simples avec le langage Python
- Savoir gérer de manière collaborative un projet avec Git
- Savoir manipuler les structures de données
- Comprendre les modules en Python
- Etre capable de mener des analyses bioinformatiques avec Biopython
PUBLIC
Ingénieurs et chercheurs. Biologistes et chimistes de formation souhaitant s'initier à la programmation pour la bioinformatique
PRÉREQUIS
Aucun prérequis en matière de programmation. Le stage s'effectuera sous Linux en mode ligne de commande. Savoir utiliser un éditeur de texte est conseillé.
PROGRAMME
Cette formation introduira le langage Python, l'outil de gestion de projet Git ainsi que le module BioPython permettant l'analyse de données biologiques. L'objectif est qu'à l'issue du stage, les participants soient capables de maintenir et développer de façon collaborative une application d'analyse de données biologiques en Python.
- Le langage Python et ses commandes essentielles
- Le logiciel Git de gestion de version
- Les structures de données en Python
- Approche des classes et de la programmation objet
- Les modules en Python
- Le module Biopython
Alternance de cours (50 %) et travaux pratiques et dirigés (50 %)
INTERVENANTS
B. Dartigues et A. Miniussi (ingénieurs)
Responsable
- Nom : Benjamin Dartigues