Les ressources humaines et matérielles disponibles sur la plate-forme sont mises à profit pour la formation d’étudiants (stagiaires, doctorants…), d’ingénieurs et techniciens et pour des programmes d’animation et de formation scientifiques et techniques (séminaires, ateliers, sessions d’études…). Le tableau ci-dessous résume l’ensemble des actions menées durant l'année 2016 dans ce domaine. Présentation des réunions d’information et de formations des plates-formes pour l’année 2016
Tout au long de l’année
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Protéome | Actions spécifiques de formation et stages pratiques en protéomique. | 24 Ingénieurs 62 Masters 1 23 Master 2 22 DUT/BTS 13 Doctorants 6 Post-doctorants |
PF Métabolome | Actions spécifiques de formation et stages pratiques en métabolomique. | 15 Masters 1 & 2 31 Doctorants 8 Post-doctorants 8 scientifiques visiteurs (6 internationaux) |
PF Métabolome | Préparation de la Plateforme à la préparation de films pédagogiques de l'Université de Bordeaux |
Master Bordeaux Biologie |
PF Génome-Transcriptome | Accueil et formation théorique et pratique aux équipements de la PGTB (étudiants, post doc et personnels scientifiques et techniques) | 13 personnes |
PF Bioinformatique | Actions spécifiques de formation et stages pratiques en bioinformatique |
3 Doctorants
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PF BioPhysicoChimie Structurale | Des formations sont organisées pour l’utilisation des spectromètres de masse disponibles en « libre service » | Ces formations ont lieu plusieurs fois en fonction des nouveaux arrivants. |
PF BioPhysicoChimie Structurale | Des formations sont organisées pour l’utilisation des spectromètres RMN disponibles en « libre service » | Ces formations ont lieu plusieurs fois en fonction des nouveaux arrivants. |
PF Imagerie photonique |
Formation à la carte en microscopie à épi-fluorescence, confocal, multi-photonique, traitement d’images, technique de FLIM, technique de microscopie confocale rapide, technique de FRAP | 46 ITA ou chercheurs 19 Post-doctorants 38 Doctorants 11 Étudiants de Master 2 2 Étudiants de Master 1 |
PF Imagerie électronique |
Formation des utilisateurs au maniement des microscopes électroniques | 8 ITA ou chercheurs 4 Post-doctorants 9 Doctorants 2 Étudiants de Master 2 |
PF Imagerie végétal |
Formation des utilisateurs au maniement des microscopes photoniques et électroniques et technologies associées | 18 ITA ou chercheurs 2 Post-doctorants 6 Doctorants 4 Étudiants de Master 2 2 Étudiants de Master 1 |
Janvier
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique |
Traitement et analyse d'images sous Imaris, Toulouse | 50 participants |
PF Imagerie Végétale |
Base de l'analyse d'image avec ImageJ | 10 participants |
Février
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Traitement et analyse d'image sous ImageJ | 12 participants |
PF Imagerie Végétale | Base de l'analyse d'Image avec ImageJ | 10 participants |
PF Imagerie Electronique | Base de la microscopie électronique | 19 participants |
PF Génome-Transcriptome | Nouveaux arrivants Unité BIOGECO | 10 participants |
PF Protéome | ENSTBB | 50 participants |
Mars
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Microscopie à épi fluorescence et microscopie confocale : Des bases à la pratique | 12 participants |
PF Génome-Transcriptome | Enseignements théoriques sur les technologies de séquençage. Licence Professionnelle Outils biotechnologiques au service des filières de productions agricoles (OBA) | 8 étudiants |
PF Métabolome | Demi-journée pour les étudiants de Boreaux Sciences Agro Technologies Numériques, Présentations d'applications bioinformatiques utilisées en métabolomique | 15 participants |
PF Protéome | Partenariat avec le lycée de Blanquefort (relation Lycée / ESR) | 22 participants |
Avril
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Utilisation du logiciel d'acquisition et de traitement d'images MetaMorph : bases théoriques et pratiques | 10 participants |
PF Imagerie Photonique | 8th Course on Optical Microscopy Imaging for Biosciences, Porto | 40 participants |
PF Imagerie Végétal | Base de l'analyse d'image avec ImageJ | 10 participants |
PF Bioinformatique | "Ateliers" "2 en 1" : Production et Analyses de données NGS - RNA-Seq | 95 participants |
PF Protéome | TP Protéomique - ENSTBB | 24 participants |
PF Protéome | Partenariat avec le lycée de Blanquefort (relation Lycée / ESR) | 22 participants |
Mai
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | ImageJ : les bases, INRA Versailles | 10 participants |
PF Bioinformatique | "Ateliers" "2 en 1" : Production et Analyses de données NGS - Génomes Complets | 95 participants |
PF Bioinformatique | Formation "Analyse avancée de séquences" | 12 participants |
PF Métabolome | Organisation (comité scientifique et comité d'organisation) des 10èmes journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique à Montpellier | 255 participants |
PF Métabolome | Workshop about NMR spectra processing web tools, RFMF, Montpellier | 30 participants |
Juin
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Traitement et analyse d'images sous ImageJ | 12 participants |
PF Imagerie Photonique | BIAS 2016, Heidelberg | 25 participants |
PF Imagerie Photonique | Cours ImageJ à façon programmation de macros pour l'AFM, INSERM, Marseille | 12 participants |
PF Métabolome | Workshop about lipidomic : Society of Experimental Biology, SEB 04-07 juillet 2016, Brighton | 30 participants |
Juillet
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Participation à Bordeaux School of Neurosciences: Neuronal Cell Biology-Cytoskeleton and Trafficking | 20 participants |
PF Imagerie Electronique |
Participation à Bordeaux School of Neurosciences: Neuronal Cell Biology-Cytoskeleton and Trafficking | 12 participants |
PF Imagerie Photonique | Microscopie à épi fluorescence et microscopie confocale: des bases à la pratique | 12 participants |
PF Imagerie Photonique | NeuBIAS 2016, Barcelone | 25 participants |
PF Imagerie Photonique | Participation à Bordeaux School of Neurosciences : Nutrition and Brain fonctions | 20 participants |
PF Bioinformatique | "Ateliers" "2 en 1" : Production et Analyses de données NGS - Exomes et panels de gènes | 75 participants |
PF Métabolome | Participation à l'organisation (Comité d'organisation) du 33ème congrès SFSM à Bordeaux en septembre 2016 | 250 participants |
PF Métabolome | Participation à l'UE lipidomique du Master BBM Université de Bordeaux (Biochimie et Biologie Moléculaire) | 10 participants |
Octobre
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Participation à Bordeaux School of Neurosciences : Brain Prize Hippocampus from Circuits to Cognition | 20 participants |
PF Imagerie Photonique | Atelier de microscopie confocale | 20 participants |
PF Génome-Transcriptome | Cours Séquençage NGS et Sequenom et visite du site de Pierroton - Master 2 M2 Pro Microbiologie-Immunologie, Univ. Bordeaux | 9 Etudiants |
PF Métabolome | Organisation (comité scientifique et d'organisationà des journées LipidomYstes à Toulouse | ~ 35 participants |
PF Métabolome | Formation "Spéctométrie de masse et analyse de spectres", Pr. J.C Tabet, MetaboHUB, Bordeaux | 7 participants |
PF Protéome | Cours de Protéomique IUT Mont de Marsan | 22 participants |
Novembre
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Participation à Bordeaux School of Neurosciences : Glial cells in health and disease | 20 participants |
PF Imagerie Photonique | Cours ImageJ à façon programmation de macros/construction de workflows, INRA Versailles | 12 participants |
PF Imagerie Photonique | Participation au Master 1 Génie Physiologique, biotechnologique et informatique option bioimagerie : introduction aux macros sous ImageJ, Poitiers | 8 participants |
PF Imagerie Photonique | Introduction à la mesure de la mobilité de la protéines par FRAP et SPT | 10 participants |
PF Imagerie Photonique | Cours ImageJ à façon programmation de plugins pour l'AFM, INSERM Marseille | 10 participants |
PF Imagerie Electronique | Atelier - Master Biologie santé, spécialité Bioimagerie | 2 participants |
PF Bioinformatique | "Ateliers" "2 en 1" : Production et Analyses de données NGS - Métagénomique | 65 participants |
PF Bioninformatique | Formation "Analyse avancée de séquences" | 12 participants |
PF Bioinformatique | Formation "Fouille de données et analyse de données NGS avec R" | 12 participants |
PF Bioinformatique | Formation "Python pour la Biologie" | 12 participants |
PF Génome-Transcriptome | Visite du site de Pierroton - Scientifiques dans le cadre du séminaire RESIST | 25 participants |
PF Génome-Transcriptome | Visite du site de Pierroton - Scientifiques dans le cadre du GDR Bios | 8 participants |
PF Protéome | Formation Doctorant - Postdoctorant | 19 participants |
Décembre
Plateforme | Actions | Equipe |
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PF Imagerie Photonique | Demi-journée Master 1 Bioimagerie | 4 participants |
BIC | Journée Super Résolution | 41 participants |
PF Génome-Transcriptome | Cours Séquençage NGS et visite du site de Pierroton - Master 1 Microbiologie Immunologie, UE Séquençage haut Débit et Applications, Université de Bordeaux | 30 étudiants |
PF Protéome | Master 1 | 62 participants |