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Thèse Jordi PACAUD "Revue de la littérature sur la région non codante du BK virus"

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Jordi PACAUD


"Revue de la littérature sur la région non codante du BK virus. Illustration par l'étude de la région non codante du BK virus chez 18 patient bordelais."

 

Résumé :

Le BK virus (BKPyV) est un virus à ADN de la famille des Polyomaviridaedécouvert en 1971. C’est un virus ubiquitaire, strictement humain dont le réservoir s’établit après la primo-infection dans le rein et le tractus urinaire. La primo-infection et les réactivations sont habituellement asymptomatiques mais constituent cependant une  menace  pour  la  santé  des  patients  immunodéprimés  en  contexte  de  greffe  rénale  ou  de  greffe  de  cellules souches hématopoïétiques. La  région  non  codante  du  BKPyV,  remarquable  parsa  plasticité,  peut  se  présenter  sous  forme  sauvage dite«archétype»  ou  réarrangée  comportant  des  duplications  et  délétions  en  bloc.  Par  son  interaction  avec  des facteurs de transcription cellulaire, elle orchestre la réplication de l’ADN viral ainsi que  la  transcription  de  gènes viraux  précoces  et  tardifs.  L’origine  et  la  signification  des  réarrangements  est  incertaine.Des   données expérimentales  suggèrent  que  les  souches  de  BKPyVarborant  des  réarrangements  seraient  associées  à  une pathogénicité  plus  importante,  un  tropisme  cellulaire  élargi  ou  encore  un  pouvoir  transformant  accru.  Ces caractéristiques peinent toutefois à être confirmées in vivo.Afin d’illustrer ces problématiques, nous avons séquencé puis analysé la structure de la région non codante du  BKPyV  répliquant  à  haut  niveau  dans  les  urines  de  18  patients  en  situation  de  greffe  de  cellules  souches hématopoïétiques entre le 01/04/2019 et le 31/03/2020 au CHU de Bordeaux. L’ensemble des régions non codantes du  BKPyV  séquencées  était  de  conformation  archétype.  Les  réarrangements  de  la  région  non  codante  semblent donc être un évènement rare et non associé à une réplication intense ainsi qu’à la survenue de cystite hémorragique liée au BKPyV. Un polymorphisme de plusieurs nucléotides a par ailleurs été mis en évidence et pourrait affecter la distribution des sites de liaison aux facteurs de transcription selon notre analyse prédictive. L’influence de ces variations de séquence sur transcription des gènes viraux reste néanmoins à être précisée.

Responsable

  • Nom : PACAUD Jordi